Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMX4Q9H1E5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMX4Q9H1E5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms