Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDGFDQ9GZP0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDGFDQ9GZP0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms