Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPR88Q9GZN0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms