Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CEP44Q9C0F1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CEP44Q9C0F1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms