Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCAPERQ9BY12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCAPERQ9BY12 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms