Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF17Q9BXT8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF17Q9BXT8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms