Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARD11Q9BXL7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms