Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf16Q9BUW7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms