Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBF4Q9BQW3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBF4Q9BQW3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms