Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED2Q99967 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms