Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MYD88Q99836 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYD88Q99836 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms