Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCNX1Q96RV3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms