Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CICQ96RK0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CICQ96RK0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms