Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms