Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC38A2Q96QD8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms