Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20AQ96MK3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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FAM20AQ96MK3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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FAM20AQ96MK3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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