Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FGD4Q96M96 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD4Q96M96 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms