Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC7Q96M83 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC7Q96M83 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms