Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM47Q96LD4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM47Q96LD4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms