Protein–RNA interactions for Protein: Q96KV7

WDR90, WD repeat-containing protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR90Q96KV7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR90Q96KV7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR90Q96KV7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms