Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC41A2Q96JW4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms