Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEURL4Q96JN8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEURL4Q96JN8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms