Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COG3Q96JB2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms