Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms