Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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