Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRT1Q96EB6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRT1Q96EB6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms