Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MTERF3Q96E29 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms