Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP4CQ96CF2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP4CQ96CF2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms