Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFHD2Q96C19 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFHD2Q96C19 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms