Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKL1Q969V6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms