Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TOPBP1Q92547 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOPBP1Q92547 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms