Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PYDC1Q8WXC3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PYDC1Q8WXC3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms