Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY2Q8WXA3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY2Q8WXA3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms