Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOBEC4Q8WW27 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms