Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF4Q8WV16 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF4Q8WV16 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms