Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC4Q8TDY8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC4Q8TDY8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms