Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RB1CC1Q8TDY2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RB1CC1Q8TDY2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RB1CC1Q8TDY2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RB1CC1Q8TDY2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RB1CC1Q8TDY2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
RB1CC1Q8TDY2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RB1CC1Q8TDY2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms