Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA6DQ8NFY4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms