Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MYRIPQ8NFW9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MYRIPQ8NFW9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms