Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF548Q8NEK5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF548Q8NEK5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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