Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACBD4Q8NC06 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms