Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC82Q8N4S0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms