Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNL3Q8IZI9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNL3Q8IZI9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNL3Q8IZI9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNL3Q8IZI9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms