Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF2Q8IX21 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF2Q8IX21 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms