Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC84Q86UT8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms