Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CATSPER4Q7RTX7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms