Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q71RC1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q71RC1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q71RC1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q71RC1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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