Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP43Q70EL4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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