Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM179Q6ZVK1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM179Q6ZVK1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms