Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC129Q6ZRS4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC129Q6ZRS4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms